除了它的优点外，ODBC还有一些缺点。以下是ODBC的主要缺点。
不断变化： ODBC由Microsoft提供，并且像其他Microsoft产品一样，它也在不断发展，使用ODBC的公司应该跟上它。除此之外，您需要付费才能使用ODBC SDK 8和更高版本。
JNI库的用法：尽管ODBC通过提供通用API与所有数据库进行交互来解决供应商依赖性问题，但最终ODBC还是本机API，因此您需要在Java应用程序中使用JNI，这是不建议的。
不确定：由于Microsoft承诺提供对OLE / DB的支持，而OLE / DB更倾向于基于对象的编程而不是过程性的编程。我们不能假设未来会怎样。
构建复杂： ODBC是驱动程序，构建和维护有点复杂。
可靠性取决于基础框架：由于ODBC规范仅指定应用程序协议，因此ODBC头继承了它使用的框架的功能。因此，可靠性取决于底层框架的请求响应协议的实现。
没有标准化的服务器：在ODBC中，由于大多数工作是由客户端完成的，因此很难扩展。除此之外，ODBC驱动程序服务器还不够标准化。因此，客户端维护自己的驱动程序，命名表和宏，这使大型站点的管理变得复杂。
大型数据库运行缓慢：虽然与大型数据库管理系统一起使用时易于使用，但ODBC会很慢。